上文提及，「阿彌陀佛」這個名號十分殊勝，蘊含強大修持力量，無量無邊不可思議的功德。
有一點要注意的，就是關於「阿彌陀佛」的讀音，特別是第一個字「阿」的發音，有人念作「哦」（ò），有人念作「喔」（wō），有人念作「婀」（ē），也有人念作「阿」（ā）。那麼，到底哪個是對，哪個是錯？
曾經有佛弟子問淨空法師這個問題，他的回答是：
「這個音到底哪個音正確，很難說，那一定要問釋迦牟尼佛。我們任何一個國家民族的語言音聲，古今差別很大，這是一定的道理。對從前這個咒，念的時候都很靈，現在咒念的都不靈，甚麼原因？音不準確。可是音雖然不準確，有一個方法，你能夠真誠恭敬，音不準確也沒有關係，至誠能感通。就像我們跟一般人交往，我們語言不同，但是他那個誠懇的心落在他的眼神上，他的態度上，我們能夠感受。雖然語言不同，可以能感受得到這個人很誠懇，這個人很老實，這個人是個好人，能夠感通，所以至誠感通。」（淨空法師：〈阿彌陀佛的「阿」字應如何念？〉）
咒語靈不靈，主要看誠意，發音還是其次。心裏頭有佛，心誠則靈；只是口中有佛，心中沒有，口念彌陀心散亂，心内胡思亂想，喊破喉嚨也枉然。所以，淨空法師總結的說：「……我們不需要在這裏去計較，總是真誠清淨平等，最重要的還是把妄想分別執著斷掉，你的心跟佛心就相應。真心現前，這比甚麼都重要，所以不在形式。」
研究音聲能量與療癒功效的學者卻有另一番見解，他們堅持「阿彌陀佛」中的「阿」字必須念作「阿」（ā）音，其他讀音都是錯誤的。國學大師南懷瑾先生便是其中一人，他認為「阿」並不發「哦」（ò）音。「哦」的發音是嘴部收縮成一小圈，單從喉部發聲，是輪迴的音，輪迴音是下沉的、沉墜的。「阿彌陀佛」中的「阿」字必須念作「阿」（ā），「阿」是一切眾生的開口音，嘴巴張開，在喉部、胸部發音，開發的、清朗的、上揚的，示現生命的生生不息。
密宗有許多梵文真言，在這些咒語中存在三個種子音，分別是「唵」（ong）、「阿」（a）、「吽」（hong）。這三個種子音也就是普賢如來現身金剛薩埵的根本咒。南懷瑾曾指出「阿」（ā）的意思是「無量無邊，無際無盡，生生不息，開發光明。」如果念成「哦」（ò）或其他音就有偏差了。「阿」（ā）是「宇宙開闢，萬有生命生發的根本音。它具有無量、無際的功能」，善用這個妙音，就可以「打開身體內臟的脈結，同時可以清理腑臟之間的各種宿疾。」（南懷瑾：《道家密宗與東方神秘學》，2010）
我們熟悉的觀音心咒──唵嘛呢叭咪吽（oṃ maṇi padme hūṃ）──亦即六字大明咒，便包含了以上三個種子音的其中兩個，即「唵」（ong）和「吽」（hong）。
南懷瑾指出，「唵」（ong）是「宇宙原始生命能量的根本音。它含有無窮、無盡的功能」，念誦唵字可以「使頭腦清醒、精神振發。如果是傷風感冒，連續不斷地唸此字音，可以使頭部發汗，得到不藥而癒的效果。」至於「吽」（hong）字，則是「萬有生命潛藏生發的根本音」，因為吽字是丹田音聲，念誦吽字可以「震開脈結啟發新的生機。最低限度，也可以達到健康長壽的效果。」
人類文明發展了五千多年，對於音聲的神秘功能似乎尚未窮其究竟。如訴諸科學，以上音聲的神秘功能必然無法得到合理的解釋。也許人類仍未具足智慧與科技去解開箇中之謎。但相信以上說法的人皆認為，正確念出這些根本音具有不可思議的功德，它們當中醞藏了宇宙的大智大能，奧妙無窮，時常念誦，堅持修習，日久功深，可振動氣脈，強身健體，延年益壽。
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